Η κρυπτογράφηση αποτελεί το θεμέλιο λίθο του Bitcoin, πάνω στον οποίο είναι χτισμένο όλο το σύστημα. Η κρυπτογράφηση που χρησιμοποιεί το Bitcoin είναι ισχυρότερη κι από αυτή που χρησιμοποιούν στις μέρες μας οι υπηρεσίες Web Banking που προσφέρονται από τα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα. Πιο συγκεκριμένα πρόκειται για κρυπτογράφηση SHA-256 η οποία αποτελεί μέρος του SHA-2 και φυσικό «απόγονο» της κρυπτογράφησης SHA-1 που χρησιμοποιείται από τις τράπεζες, ενώ και οι δύο είναι σχεδιασμένες από το National Security Agency των Ηνωμένων Πολιτειών.

Η κρυπτογράφηση SHA-2 θεωρείται απαραβίαστη με τις σημερινές μεθόδους και τεχνολογία, κάτι που μας παρέχει υψηλά επίπεδα σιγουριάς για τη χρήση και φυσικά τη διάδοση του Bitcoin σε όλα τα επίπεδα. Ακόμα και για την κρυπτογράφηση δεν είναι απαραίτητη ούτε δυνατή η επέμβαση κάποιου τρίτου, αφού όλη η διαδικασία υλοποιείται από τον αλγόριθμο του Bitcoin κι εντός του δικτύου του.